Em 1987 esse Campus se constituiu inicialmente com cinco cursos ofertados na modalidade intervalar e paulatinamente solidificando-se no município de Bragança. Em 1992 foram ofertados na modalidade regular, os cursos de Licenciatura Plena em Letras com habilitação em Língua Portuguesa, Pedagogia e Matemática. Nesse período ingressam os primeiros docentes para assumirem os cursos implantados. Em 1997, foi implantado o programa de Pós-Graduação em Biologia Ambiental e, posteriormente a criação do Instituto de Estudos Costeiros. Além de ofertar os cursos na modalidade regular e intensivo, o Campus de Bragança oferta ainda 12 cursos na modalidade presencial em Bragança e Augusto Corrêa.